Alun perin Uuden Galician valtakunnaksi kutsutun kaupungin historia jatkuu.
Siellä on myös vanha jesuiittakorkeakoulu Santo Tomás de Aquino, joka rakennettiin 1500-luvun viimeisellä vuosikymmenellä ja joka vuonna 1792 oli yliopiston käytössä. Rakennuksesta on jäljellä vain kirkko, jossa oli viime vuosisadan monumentaalinen kupoli, ja siihen liitetty Loreto-kappeli, jonka Juan María de Salvatierra rakensi vuonna 1695. San Juan de Diosin temppeli, joka oli aiemmin Santa Veracruzin kappeli, jonka Don Pedro Gómez Maraver rakensi 1500-luvulla, rakennettiin 1700-luvulla barokkijulkisivulla, jolla oli raittiit ominaisuudet. La Mercedin kirkko, jonka barokkityyli on samanlainen kuin San Juan de Diosin kirkko, onkin koristeellisempi, mutta veljekset Miguel Telmo ja Miguel de Albuquerque perustivat 1700-luvulla.
La Soledadin temppeli rakennettiin 1600-luvun lopulla ja 1700-luvun alussa Juana Romana de Torresin ja hänen miehensä, kapteeni Juan Bautista Panduron pyynnöstä. Paikalla oli yksinäisyyden Neitsyt Marian ja Pyhän Haudan veljeskunta, joka miehitti San Francisco Xavierille omistetun kappelin. San Diegon temppeli ja koulu, vuosisadan XVII teos; Ensimmäisessä on hyvin raittiinen oviaukko, joka näyttää kuuluvan jo nyt uusklassiseen tyyliin, ja toisella kauniilla pelihallilla, joka koristaa vanhaa luostaria.
Jesús Marían kirkko, joka on liitetty samannimiseen luostariin, perustettiin vuonna 1722; se säilyttää edelleen barokkityyliset julkisivunsa, joista voit nähdä suuria veistoksia, jotka edustavat Pyhää perhettä, Valon Neitsyttä, Pyhää Franciscusta ja Pyhää Dominicia.
Lopuksi on tärkeää tuoda esiin vielä kolme uskonnollista rakennetta, jotka ovat nousseet parhaina esimerkkeinä, kukin omalaatuisiksi, siirtomaa-arkkitehtuurin kehityksestä Guadalajarassa, lähinnä 1700--1800-luvuilla. Siten meillä on 1700-luvun puolivälistä peräisin oleva Aránzazun kappeli, jonka utelias kellotapuli ja sisustus on koristeltu upeilla maalauksilla ja Churrigueresque-alttaritauluilla samalta ajalta ja jota pidetään kaupungin parhaimpana. Santa Mónican luostari ja kirkko, jonka isä Feliciano Pimentel perusti 1700-luvun alkupuoliskolla; sen temppelissä on kaksinkertainen julkisivu, jossa on runsaasti koristeita, jotka on luokiteltu parhaaksi esimerkiksi ylevästä solomon barokkityylistä. San Felipe Nerin temppeli, jonka arkkitehti Pedro Ciprés rakensi vuonna 1766, muodostaa joukon ylimääräistä raittiutta, joka sisältää elementtejä, joissa on koristeessaan plateresque-muistelmia, näkökulma, joka asettaa temppelin Guadalajaran parhaaksi uskonnolliseksi rakennukseksi.
Siviili-arkkitehtuuria vastaavissa rakenteissa on joitain ihailtavia rakennuksia, joista voidaan mainita hallituksen palatsi, vanhat kuninkaalliset talot, joita muutettiin 1700-luvulla armeijan insinööri Juan Francisco Espinon projektin jälkeen, vaikka julkisivu oli teos Miguel José Conique. Rakennus on suunniteltu pääasiassa barokkityyliin, mutta siinä on jo havaittavissa tiettyjä uusklassisia taipumuksia. Kuninkaalliset toimistot, jotka olivat kadonneessa Palacio de Medranossa, ja yleisötilat toimivat alueella.
Meillä on myös San Josén omistettu Conciliar-seminaari, jonka piispa Galindo y Chávez vihki käyttöön vuonna 1701 ja jonka nykyään omistaa Guadalajaran aluemuseo, jossa on toscanalaistyylisten pylväiden luostari ja barokkityyliset oviaukot. Kuuluisa Hospicio Cabañas rakennettiin 1800-luvun alussa maineikkaan arkkitehdin Manuel Tolsán suunnitelmien mukaisesti ohjaamalla José Gutiérrezin ja vuosia myöhemmin arkkitehdin Gómez Ibarran valmistuneen teoksen, joka on merkittävä esimerkki uusklassisesta tyylistä.
Muista pienistä rakenteista, jotka antoivat tyylillisen yhtenäisyyden Guadalajaran kaupungille, voidaan mainita, vaikka kaikkia ei ole säilynyt: upea 1500-luvun kartano, joka seisoi aikoinaan San Sebastián -aukion edessä Analcon naapurustossa. Talo Calle de la Alhóndiga nro 114, nykyisin Pino Suárez. Sánchez Leñeron perheelle kuuluneet asunnot nro 37 ja herra Dionisio Rodríguezin asunnot nro 133 Calle de Alcaldessa. Calderón-talo, perinteinen siirtomaa-karkkikauppa, joka perustettiin vuonna 1729 ja joka sijaitsee Santa Teresan ja Santuarion, nykyään Morelos ja Pedro Loza, vanhojen katujen kulmassa; Francisco Velarden oma, uusklassinen tyyli, ja lopulta se, joka oli Cañedon kartano, joka sijaitsi katedraalin takana.
Maan kolmanneksi tärkein kaupunki Guadalajaran läheisyydessä on San Juan Bautista Melzquititlánin vanha kaupunki, nykyään San Juan de los Lagos. Tästä kaupungista on tullut tärkeä uskonnollinen keskus, koska Don Juan Rodríguez Estrada rakensi 1700-luvun puolivälissä sen kirkkoa säilyttävän Neitsyt Marian kuvan suuren ihmeellisen perinteen. Samassa kaupungissa voi nähdä muita rakennelmia, kuten kolmannen ritarin temppeli, Golgatan kappeli, ensimmäisen ihmeen kappeli, jotka ovat peräisin 1600- ja 1700-luvuilta. Väestössä on myös tärkeitä siviilirakennuksia, kuten kollegion palatsi ja kymmenysten rakennus.
Lagos de Morenon kaupungissa voit nähdä sen tärkeimmän seurakunnan, 1700-luvulta peräisin olevan teoksen, jossa on kaunis Churrigueresque-tyylinen julkisivu.
Lopuksi San Pedro Tlaquepaquessa on joitain esimerkkejä barokin uskonnollisesta arkkitehtuurista alueella, kuten San Pedron seurakunta ja Soledadin temppeli.
