Todennäköisesti 1500-luvun alkupuolella nykypäivän Guanajuaton alueella asuivat alkuperäiskansat Chichimecas, pääasiassa Paxtitlán-niminen paikka, jossa sammakoita oli runsaasti.
Ilmeisesti heidän seurassaan olleet Tarascan-intiaanit antoivat sille nimen Quanashuato, "sammakoiden vuoristoinen paikka". Tiedetään, että vuoteen 1546 mennessä espanjalaiset olivat jo tutkineet aluetta ja että Rodrigo Vázquez perusti karjatilan. Tuon päivämäärän ja vuoden 1553 välillä tehtiin tärkeitä löydöksiä kullan ja hopean mineraaliesiintymistä, joista merkittävimpiä teki Juan de Rayas vuonna 1550. Seuraavaan vuoteen mennessä paikalle oli asettunut neljä leiriä tai kuninkaallista vasta löydettyjen kaivosten hoitamiseksi. , joukossa tärkein nimeltään Santa Fe.
Vaikka Chichimecat hyökkäsivät jonkin verran, Real de Minas pystytettiin pormestariksi vuonna 1574, ja hän otti käyttöön Villa de Santa Fe: n Real ja Minas de Guanajuatossa. Vuonna 1679 sillä oli jo paita tai vaakuna, ja vuonna 1741 se sai kaupungin arvonimen "runsaiden hopea- ja kultakaivosten tarjoamista edullisista mukavuuksista". Kuningas Felipe V allekirjoitti todistuksen ja kutsui sitä erittäin jaloksi ja uskolliseksi Minas de Santa Fe de Guanajuaton kuninkaalliseksi kaupungiksi.
Tämä sijainti pakotti kehityksen, joka vahvisti tietyt kaupunkien ominaisuudet, jotka johtuivat maaston topografisista epäsäännöllisyydistä, sovittamalla asutuksen jakauma tähän ja piirtämällä erikoisia katuja, neliöitä, aukioita, kujia ja portaita, jotka ovat olleet arvoisia kaupunkia pidetään yhtenä maamme ihailtavimmista.
Alun perin se koostui neljästä kaupunginosasta: Marfil tai Santiago, Tepetapa, Santa Ana ja Santa Fe; Uskotaan, että jälkimmäinen oli vanhin ja että siellä oli nykyinen La Pastitan naapurusto. Kaupunkien integraatio sisälsi myös virran, joka käytännössä kulki asutuksen keskustan läpi muuttaen siitä Calle Realin, joka oli kaupungin pääakseli ja jonka sivuille, jyrkkien kukkuloiden rinteille, rakennettiin asukkaiden talot. Tämä katu, joka nykyään tunnetaan nimellä Belaunzarán, on yksi kauneimmista tavoista maanalaisille osuuksille, siltoille ja miellyttäville kulmille, jotka se muodostaa mutkittelevalle reitilleen. Tärkeimmät ja rikkaimmat rakenteet tehtiin vaaleanpunaisessa louhoksessa, kun taas vaatimattomampia Adobe- ja väliseiniä käytettiin, mikä antoi sille tyypillisen värin, joka vaihtelee punertavista vihreisiin sävyihin vaaleanpunaisen läpi; kerrostettuja saviastioita käytettiin päällysteisiin, portaikkoihin ja viiluihin.
Ylellisyys, jonka kaupunki saavutti 1700-luvulle asti, rikkaiden kullan ja hopean kerrostumien ansiosta, ilmeni sen siviili- ja uskonnollisessa arkkitehtuurissa; On kuitenkin tarpeen nimetä esimerkiksi ensimmäinen kappeli, joka siunattiin vuonna 1555, joka oli Hospital de los Indios Otomíes, noin 1589 perustettu Colegio de Compañía de Jesús -kappeli, joka sijaitsi nykyään yliopiston ja primitiivisen seurakunnan kirkossa. kutsutaan sairaaloiksi, joka on peräisin 1500-luvun puolivälistä, nykyään osittain muunnettuna ja sen julkisivuun on kaiverrettu Guanajuaton Neitsyt Marian kuva.
Kaupunki tarjoaa tiloja, joissa on poikkeukselliset puitteet ja kauniit näköalat, ja sen neliöt kehystävät eniten kiinnostavia rakennuksia, kuten San Francisco, jossa Sopeña-katu päättyy, San Franciscon temppelin edessä, barokkityylisellä julkisivulla. 1700-luku, joka on ristiriidassa viereisen Santa Casan kappelin kanssa. Sen jälkeen on Union Garden, jonka eteläpuolella seisoo San Diegon upea temppeli, jolla oli vanha luostari; temppeli vaurioitui tulvasta ja se rakennettiin uudelleen 1700-luvulla Valencianan kreivin väliintulolla. Sen julkisivu on barokkityyliä, jossa on churrigueresque-ilmaa.
Myöhemmin on Plaza de la Paz, jota ympäröivät mielenkiintoiset rakennukset, kuten hallituksen palatsi, ylimääräinen Rul-kreivien talo, 1700-luvun lopun teos, joka on annettu arkkitehti Francisco Eduardo Tresguerrasille, jolla on erinomainen julkisivu ja kaunis patio. sisällä; Gálvezin kreivin talo ja Los Chicon talo. Neliön itäpäässä on 1700-luvulla raittiiseen barokkityyliin rakennettu Nuestra Señora de Guanajuaton vaikuttava basilika, jonka pääalttarissa on arvokas kuva Santa Fe de Guanajuaton naisesta. Basilikan takana on toinen aukio, joka edeltää Jeesuksen seuran ylellistä temppeliä, joka rakennettiin vuonna 1746 Don José Joaquín Sardaneta y Legazpin tuella. Rakennuksessa on yksi Meksikon kauneimmista barokkijulkisivuista, ja arkkitehti Vicente Heredian viime vuosisadalla lisäämä valtava kupoli erottuu. Tämän temppelin länsipuolella on yliopiston kampus, joka oli jesuiittojen perustama Colegio de la Purísima 1500-luvun lopulla; rakennusta muutettiin 1700-luvulla ja joitain enemmän tämän vuosisadan puolivälissä. Yrityksen itäpuolella on Plaza del Baratillo, jolla on kaunis suihkulähde, jonka Firenze on tuonut keisari Maximilianon tilauksilla, ja jonka länsipuolella on San Josén temppeli.
Jatka Juárez-kadulla, ohitat 1800-luvun rakennuksen Lakipalatsin; edelleen on rakennus, joka oli aikaisemmin kuninkaallinen oikeudenkäyntitalo, erinomainen barokkityylinen kartano, jonka julkisivulla oli kaupungin ensimmäinen jalo vaakuna. Sieltä pieni poikkikadu kulkee Plaza de San Fernandon läpi päästäksesi Plazuela de San Roquelle, viehättävään siirtomaa-nurkkaan, joka kehystää saman nimisen kirkon ja joka on vanhin säilynyt, rakennettu vuonna 1726. Kompleksi puolestaan tarjoaa pääsyn miellyttävään Morelos-puutarhaan, joka edeltää Belénin temppeliä, joka on 1700-luvulta peräisin oleva rakennus, jossa on vaatimaton portaali ja kauniit alttaritaulut. Temppelin yhdeltä puolelta katu, joka kulkee pohjoiseen, johtaa Alhóndiga de Granaditas -rakennukseen; Viljan ja elintarvikkeiden varastointiin suunniteltu rakennus aloitettiin vuonna 1798 arkkitehti Durán y Villaseñorin hankkeen pohjalta, joka valmistui vuonna 1809 José del Mazon valvonnassa. Sen yleiskuva on kaunis näyte Meksikon uusklassisesta siviiliarkkitehtuurista.
Kaupungin tyypillisiä tiloja ovat aukiot ja kujet, joista voidaan mainita Plasuela de la Valenciana, Los Ángeles, Mexiamora, kuuluisa ja romanttinen Callejón del Beso ja Salto del Mono. Muita tärkeitä uskonnollisia rakennuksia ovat 1700-luvulla raittiiseen barokkityyliin rakennettu Guadalupen temppeli, myös 1700-luvulta peräisin oleva El Pardon temppeli, jonka julkisivu on täynnä louhoksessa mestarillisesti toteutettuja kasvikuvioita.
Historiallisen keskuksen ulkopuolella, pohjoisessa, on Valencianan temppeli, joka on omistettu San Cayetanolle, jonka hienoa churrigueresque-julkisivua 1700-luvulta on verrattu Sagrarion ja Santísiman meksikolaisiin Meksikossa. Temppeli rakennettiin Don Antonio de Obregón y Alcocerin, Valencian ensimmäisen kreivin, pyynnöstä vuosina 1765–1788. Kotelossa on joitain upeita alttaritauluja ja arvokas saarnatuoli, joka on upotettu luuhun ja arvokkaaseen puuhun. Myös Katan temppeli ansaitsee erityistä huomiota. Don Quijotena tunnetun aukion edessä nostettu se on toinen erinomaisista esimerkkeistä meksikolaisesta barokista, jonka julkisivu kilpailee Valencianan kanssa. Se sijaitsee samannimisessä kaivoskaupungissa ja sen rakentaminen on peräisin 1600-luvulta.
