Vain kolmen tai neljän kuukauden sateella vuodessa Colima pystyi täyttämään ihmiselämälle tarvittavat olosuhteet Volcán de Fuegon yläosista tulevien lukuisien virtojen ansiosta. Todisteet osoittavat, että ihminen asui tähän laaksoon noin 1500 eKr.
Kulttuuri, joka tunnetaan nimellä Complejo Capacha, oli maatalous- ja istumisyhteiskunta, joka sai alkunsa kuuluisasta kuoppahautojen perinnöstä: hautauskammioista, joissa oli runsaasti uhreja ja joihin pääsee pystysuoran ja pyöreän akselin kautta välillä 1,20-1,40. m halkaisijaltaan. Tampumachayn virkistyskeskuksessa, Los Orticesin kaupungissa, on kolme hautaa, joissa on alkuperäinen varsi ja holvit, sekä joukko kuolleille tarjottuja kiviastioita ja työkaluja.
Kun uskonnolla oli suurempi painoarvo yhteiskunnallisessa organisaatiossa, vuodesta 600 jKr, seremoniatilat alkoivat rakentaa neliöistä, rajatuista pihoista ja huomattavan kokoisista suorakulmaisista alustoista. Arkkitehtonisesti monimutkaisemmat asutukset syntyivät vasta 900 jKr.
Paikka, joka parhaiten edustaa tätä vaihetta, on La Campana. Se on suuri asutus - sen seremoniallinen alue ylitti 50 hehtaaria - ja peräkkäin suorakulmaisia alustoja. Näiden alustojen yläosassa on todennäköisesti viljan varastointiin liittyviä alueita. On myös monimutkaisia asuinjärjestelmiä, joissa epäilemättä on pitänyt olla siviilien ja uskonnollisten johtajien käytössä.
Kaksi näkökohtaa erottuu tällä sivustolla: seremoniallisiin tiloihin integroitujen hautahautojen sijainti ja monimutkaisen viemäriverkoston ja vesijohtojen olemassaolo.
Toinen tärkeä arkeologinen alue Colimassa on El Chanal, joka sijaitsee noin 6 km kaupungista pohjoiseen, jonka pinta-alan on täytynyt olla enintään 200 hehtaaria. Koska se ulottuu Colima-joen molemmille rannoille, se tunnetaan nimellä El Chanal Este ja El Chanal Oeste. Vaikka viimeksi mainittua ei ole täysin tutkittu, se on ilmeisen monimutkainen, koska sillä on sisäpihoja, aukioita, rakenteita, kanavia ja katuja. El Chanal Este puolestaan tuhoutui suurelta osin, koska sen raunioille perustettiin moderni kaupunki, jolla on nimensä.
Tutkimukset osoittavat, että paikalla on kaksoistemppelin ohjeellisia elementtejä, penkki-alttarin käsite ja pienikokoiset alttarialustat sekä suuri joukko irtoveistoksia, kaiverruksia ja kivireliefejä; ksantileihin liittyvät luvut; monivärinen keramiikka, joka muodostaa kotkien ja sulkaisten käärmeiden ääriviivat; ja lopuksi metalli. Mutta tämän kulttuurin merkittävin asia on urbaani ilmiö ja kalenterin olemassaolo.
