Calleja oli keskusarmeijan (1810–12) järjestäjä ja päällikkö vapaussodan aikana ja Uuden Espanjan kuusikymmentä varakuningas, joka hallitsi vuosina 1813–1816 ja oli yksi Meksikon historian suurista roistoista.
Hän syntyi Medina del Campossa Valladolidissa ja kuoli Valenciassa. Hän teki ensimmäisen kampanjansa toisena luutnanttina epäonnistuneessa Algerin retkikunnassa, jota kreivi O'Reilly johti Kaarle III: n hallituskaudella. Hän oli 100 kadettiyrityksen opettaja ja kapteeni, joiden joukossa olivat Joaquín Blacke, valtionhoitaja Espanjan jälkeen, ja Francisco Javier de Elío, tuleva Buenos Airesin varakuningas, Puerto de Santa Marían sotilakoulussa.
Hän saapui uuteen Espanjaan Revillagigedon toisen lukumäärän (1789) kapteenina Pueblan kiinteään jalkaväkirykmenttiin ja suoritti useita tehtäviä, kunnes hänet nimitettiin San Luis Potosí -prikaatin komentajaksi. Hänellä oli siellä komentonsa alla varakuningas Marquinan kokoaman joukkojen kantoni, jonka kapteeni Ignacio Allende seurasi seurueensa kanssa. Siellä hän myös avioitui Doña Francisca de la Gándaran kanssa, joka oli kaupungin kuninkaallisen vänrikki tytär, joka oli suuren Hacienda de Bledosin omistaja; ja hän sai suuren vaikutuksen maan kansaan, joka tunsi hänet mestarina Don Felixinä.
Kun Hidalgon kapina tapahtui, odottamatta varakuninkaan käskyjä, hän laittoi prikaatin joukot aseille, lisäsi niitä uusilla ja järjestäen ja kurittamalla niitä, hän muodosti keskuksen pienen (4000 miestä) mutta voimakkaan armeijan, joka onnistui voittamaan Hidalgo ja kohdata Moreloksen aloittama valtava hyökkäys.
Eläkkeelle siirtynyt Calleja Meksikoon Cuautlan piirityksen jälkeen (toukokuu 1812), hänellä oli asunnossaan (Casa de Moncada, jota myöhemmin kutsuttiin Palacio Iturbideksi) pieni tuomioistuin, jossa tyytymättömyys Venegasin hallitukseen, jota he syyttivät rahan puutteesta ja voimaton vallankumouksen hillitsemiseksi ja lopettamiseksi. Noin 4 vuotta myöhemmin hän hallitsi maata varakuninkaana. Hän sai armeijan valmiiksi saattamalla sen tavoittamaan 40 000 linjajoukkojen ja maakunnan miliisien miestä ja yhtä monta kuninkaallista järjestäytyi kaikkiin kaupunkeihin ja kartanoihin, jotka molemmat lähtivät enimmäkseen vallankumouksessa olevista maakunnista; hän organisoi uudelleen julkisen talouden, jonka tuotteet lisääntyivät uusilla veroilla; se palautti kauppatavaraliikenteen tiheillä saattueilla, jotka kiertivät jälleen valtakunnan päästä toiselle, ja säännöllisen postipalvelun; ja kasvattivat suorituskykyä ja tullituotteita.
Tämä edellyttää hänen jatkuvaa ja intensiivistä kampanjaa kapinallisia vastaan, joihin Morelos suostui. Päättäväinen ja häikäilemätön mies ei pysäyttänyt itseään tiedotusvälineissä ja sulkenut silmänsä komentajien tekemiin väärinkäytöksiin, jos ne palvelivat todellista syytä innokkaasti. Siksi hän teki itsestään vihaavan aikalaisiaan.
Palattuaan Espanjaan hän sai Calderónin kreivin arvonimen (1818) sekä Isabel la Católican ja San Hermenegildon suuret ristit. Andalusian kenraalikapteenin ja Cádizin kuvernöörin jälkeen hänellä oli Etelä-Amerikan tutkimusmatkojen joukot, jotka nousivat ennen lähtöään ja vähensivät hänet vankilaan (1820). Vapautettuaan hän kieltäytyi Valencian hallituksesta ja hänet vangittiin jälleen Mallorcalla vuoteen 1823 asti. "Puhdistettuna" vuonna 1825 hän pysyi Valencian kasarmissa kuolemaansa saakka.
