Oaxacan valloitus oli suhteellisen rauhallinen, koska Zapotecin ja Mixtecin lordit ajattelivat löytävänsä eurooppalaisilta liittolaiset, joita he tarvitsivat atsteekkien voittamiseksi.
Toisaalta muut ryhmät, kuten Sierran zapotecit, Chontales ja erityisesti Mixes, vastustivat kapinallisten jatkoa. Voittonsa jälkeen ja vielä 1500-luvulla espanjalaiset riisuivat alkuperäiskansat maistaan laillistamalla tämän toiminnan kuninkaan antamien encomiendojen, mercedesien ja jakautumisten kautta ja esittelemällä siten Espanjan valloituksen alusta lähtien epätasapainoa ja epätasa-arvo, joka vallitsisi espanjalaisen ja alkuperäiskansojen välillä.
Kolonisaattoreiden väärinkäytökset olivat niin runsaita, että hyvä osa Audiencian ja varakuningas Antonio de Mendozan tekemästä työstä oli tarkoitettu Valle de Oaxacan markiisin, Hernán Cortésin ja encomenderosin vallan rajoittamiseen. He ehdottivat siten kuninkaallisen vallan vahvistamista, ja siksi uudet lait (1542) julistettiin ja monimutkainen hallinto luotiin. Mixtecin ja Zapotecin alueen evankelioinnin tehtävä oli Dominikaanisen järjestön työ, joka rakensi pohjimmiltaan alkuperäiskansojen työllä ylellisiä kirkkoja ja luostareita paikkoihin, joihin suuret asutuskeskukset keskittyivät, kuten Antequeran kaupunkiin, Yanhuitiániin ja Cuilapaniin. .
Henkinen valloitus oli radikaali ja väkivaltainen kuin sotilaallinen valloitus. Väestön hallinnan ylläpitämiseksi valloittajat ylläpitivät muutoksin tiettyjä alkuperäiskansojen rakenteita siten, että jotkut Oaxaca-laakson ja Mixteca Altan päälliköistä onnistuivat säilyttämään muinaiset etuoikeudet ja ominaisuudet; Sen sijaan, jotta lähetyssaarnaajat käännyttäisivät Amerikan kansat kristinuskoon, he pyrkivät tuhoamaan kaikki jäljet espanjalaisen maailman eduskunnasta.
Huolimatta alkuperäisväestön väestörakenteen vähenemisestä, joka johtuu epidemioista ja huonosta kohtelusta, 1500-luku oli talouskasvua uusien tekniikoiden, viljelykasvien ja lajien käyttöönoton vuoksi. Esimerkiksi Mixtecassa saatiin hyviä voittoja silkkiäistoukkien, karjan ja vehnän hyödyntämisestä. Kaupunkimarkkinoiden ja kaivosten kehitys vaikutti tähän kasvuun.
Tämän vaurauden keskeytti kuitenkin ongelmat, joita kaivostoiminnalla oli vuodesta 1590 lähtien. Sevillan ja Amerikan välinen kauppa väheni ja väestön väheneminen aiheutti kaupunkien kulutuksen vähenemisen ja työvoiman vähentyneen vähimmäistasoonsa.
Seitsemästoista vuosisadalla taloudellinen masennus oli silloin, kun siirtomaa-asteet määriteltiin, dominointijärjestelmä vakiinnutettiin ja perustettiin riippuvaisen talouden mekanismit. Monopoliaseman ja keskitetyn kaupallisen järjestelmän soveltaminen haittasi alueellista taloudellista kehitystä, mikä sai niin rikkaat alueet kuin Oaxacan laakso suuntaamaan taloutensa kohti omavaraisuutta huolimatta kaakaon, indigon ja kokeniinin tuotannon ja kaupan tärkeydestä. .
Jo seitsemästoista vuosisadan toisella puoliskolla Uuden Espanjan talous alkoi parantua: kaivostuotannolla oli elpyminen, kauppa Keski-Amerikan ja Perun kanssa oli jälleen sallittua ja alkuperäiskansojen alkoi elpyä. Tähän mennessä Mixtecassa ja Oaxacan laaksossa asuvat espanjalaiset omistautuivat karjankasvatukseen suuressa määrin, ja haciendat yhdistivät onnistuneesti vehnän ja maissin tuotannon karjan kasvattamiseen. Siirtomaa-talous rakennettiin uudelleen vuosina 1660–1692, mikä loi perustan valaistumisen vuosisadalle.
Uusi Espanja kasvaa ja menestyy valaistumisen aikakaudella. Alue kaksinkertaistuu, väestö kolminkertaistuu ja taloudellisen tuotannon arvo kuusi kertaa. Paras esimerkki näistä edistysaskeleista on kaivostoiminta, joka on keskeinen taloudellinen akseli, joka oli edelleen orjuuttava, mutta työskenteli 3 300 000 pesoa vuonna 1670 27 000 000 pesoon vuonna 1804.
Uuden Espanjan ylellisyys ilmenee voimakkaassa rakennustoiminnassa ja tulvissa barokin upeudessa, juuri silloin Antequeraan he rakensivat muun muassa Santo Domingon kirkon rukouskappelin, Soledad, San Agustín ja Consolación.
1700-luku oli Bourbon-kuninkaiden toteuttamien poliittisten ja taloudellisten uudistusten nykyaikaistamisen vuosisata.
Vuoteen 1800 mennessä Meksikosta oli tullut ylimääräisen vaurauden, mutta myös äärimmäisen köyhyyden maa, suurin osa väestöstä oli kiinnittynyt haciendoihin ja kuntiin, heitä kohdeltiin huonosti työpaikoilla, orjuutettiin kaivoksissa ja myllyissä ilman vapautta, ilman rahaa. ja ilman mahdollisuutta parantaa.
Niemimaan espanjalaiset hallitsivat poliittisen ja taloudellisen vallan; Tällaiset sosiaalisen, taloudellisen ja poliittisen eriarvoisuuden olosuhteet keräsivät jännitteitä ja tyytymättömyyttä. Toisaalta Ranskan vallankumouksen, Yhdysvaltojen itsenäisyyden ja Englannin teollisen vallankumouksen kaltaisten tapahtumien vaikutus ravistaa Yhdysvaltojen omantuntoa ja ajatus Uuden Espanjan itsenäisyydestä alkaa kehittyä kreoleissa.
